Программа стартовала в Амурской области в 2014 году. В ее рамках разработан и реализован комплекс мероприятий, направленных на минимизацию негативного воздействия от строительства Нижне-Бурейской ГЭС на окружающую среду и биологическое разнообразие. В районе будущего водохранилища был создан первый в Амурской области природный парк «Бурейский» площадью 132 тыс. га, который стал базой для демонстрации эффективности мероприятий по сохранению биоразнообразия. В парке устанавливали особые подкормочные комплексы на отдалении от кромки водохранилища, чтобы отвлечь животных из зоны затопления. Для сохранения краснокнижной утки-мандаринки впервые в России амурские орнитологи создали искусственные дуплянки, и в первый же год половина из них была заселена. В нижнем бьефе Нижне-Бурейской ГЭС установили пять искусственных опор для дальневосточного аиста – особо охраняемого вида птиц.
Также в рамках «Бурейского компромисса» с заполнением водохранилища до промежуточной отметки 128 м и с началом заполнения до отметки 138 м прошла операция «Мазай»: люди вели патрулирование затапливаемых территорий и помогали животным эвакуироваться из зоны затопления.
В течение нескольких лет специалисты переселяли редкие виды растений из зоны влияния Нижне-Бурейской ГЭС. В общей сложности вручную было пересажено более 400 экземпляров редчайших растений. Дальнейшие наблюдения показали, что все виды успешно прошли годичный цикл и прижились на новом месте.
Таким образом, перед заполнением ложа водохранилища Нижне-Бурейской ГЭС были приняты беспрецедентные меры, направленные на сохранение биоразнообразия долины реки Буреи. Такого рода комплексных экологических программ при строительстве крупного энергетического объекта в России еще не было.